A、与乘客协商后收取

B、按计程计价设备显示的金额收取

C、按乘客愿意支付的金额收取

D、按出租汽车公司规定收取

答案：B

分析：根据《出租汽车驾驶员从业资格管理规定》：乘客乘坐出租汽车过程中如遇等候，收取等候费正确的做法是按计程计价设备显示的金额收取。